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Simulando el plegado de las proteínas 2004-08-11


Todos recordamos que en el año 1996 un computador de IBM, de nombre Deep Blue, había vencido al Kasparov jugando al ajedrez.

Las siguientes noticias fueron que a Deep Blue lo dedicaban a estudiar el plegado de las proteínas, donde se necesita una potencia de cálculo brutal. Lo hacía dentro del proyecto Blue Gene. Lo de Blue por IBM y lo de Gene por Gen.

Deep Blue, ya viejecito -6 años- ha cedido sus saberes a otros supercomputadores, que, aunque llevan su mismo nombre no tienen mucho que ver con él, salvo que son multicomputadores.

En 2003 investigadores del laboratorio IBM de Zurich anunciaban que habían descubierto -inesperadamente- que la progesterona, una hormona, se une a las proteínas por sus dos terminaciones. Hasta ese momento todos creían que se unía solamente por un lado. El resultado es que se une por los dos.

El descubrimiento se había con un nuevo ordenador del proyecto Blue Gene, con modelos que simulaban el comportamiento de la progesterona y de las proteínas.

Este descubrimiento tendrá impacto en el modo como se fabriquen drogas que interfieran con la progesterona.

Cada vez las simulaciones de muchos procesos químicos dan resultados más interesantes.



El “animalito” (Blue Gene/L) funciona con Linux.

Observación: esto son notas que utilizo en mis programas. No están bien escritas. Son a vuela pluma. Si le interesa el tema, puedo prepararle una versión más elaborada.

Enviado por flexarorion a las 01:00 | 0 Comentarios | Enlace


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